Бывает все ок, а бывает. и у меня активное окно не есть активным на панели задач. Например открыто ФФ. Запускаю пиджин, открывается его окно, я могу туда писать сообщения, но на панели задач активным осталась ФФ. Если я жму на кнопку “свернуть” на пиджине, он сворачивается, но вот если я жму на пиджин на панели задач, то он вместо того, чтобы свернутся остается на месте. мол активна же сейчас ФФ, а не я. Что с этим делать? (OpenSuse 12.1)
Интересная тема. У меня такое с kwrite бывает, хотя это и не сильно напрягает.
http://i.imm.io/eFzU.png - вот скрин. Сейчас на самом деле у мены активная фф, но панел задач показывает что консоль. Я хочу свернуть мозиллу, жму на ее окно, а оно не своривает. 
Видимо это BUG
У меня тоже самое.
Стараюсь не обращать внимание.
Снес 12.1, поставил 11.4. Там все ок, и вообще намного стабильнее версия!!